提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
四川成都至甘肃兰州铁路全线T梁架设完成******
中新网阿坝1月17日电 (记者 刘忠俊)17日下午，随着最后一片长24米、重100吨的T型梁稳稳落在镇江关车站1号五线特大桥桥墩上，标志着四川成都至甘肃兰州铁路成都至川主寺(黄胜关)段(下称：成兰铁路成川段)T梁全部架设完成，为该条铁路全线贯通打下了坚实基础。
成兰铁路成川段位于四川省境内，项目在成都青白江站与既有成绵乐接轨，经德阳、绵阳至阿坝州，在黄胜关与在建的西宁至成都铁路接轨，设计时速200公里，线路全长约275.8公里。成兰铁路成川段包含桥梁52座，15公里以上长隧道5座，桥隧比例高达79.36%，线路最大坡度20‰，需架设T梁2698孔(5396片)。
最后一片重100吨的T型梁稳稳落下。 李富彬 摄成兰铁路成川段高原区段海拔平均3000米以上，属高原高寒地区，地质条件具有“四极三高”显著特点，即地形切割极为强烈、构造条件极为复杂活跃、岩性条件极为软弱破碎、汶川地震效应极为显著；高地壳应力、高地震烈度、高地质灾害风险；给架梁施工带来极大考验。
T型架设后工人师傅正在进行焊接。 刘忠俊 摄成兰铁路公司成兰指挥部指挥长肖霞林表示，高原空气稀薄，缺氧严重，在高原区段架梁施工作业人员工作效率降低，其次高原气候条件恶劣，昼夜温差大，强对流天气多发，雨雪天气频繁，对T梁运输和架设是一个巨大挑战，T梁运输长达180公里左右。同时铁路高原段以长大隧道群居多，隧道内作业空间狭长，作业环境差，需克服隧道通讯、通风、有毒有害气体检测、长大坡道运输等诸多困难。
据了解，为加快施工进度，中铁八局设立了什邡、松潘两个制梁场。其中，松潘制梁场位于松潘县青云镇境内，毗邻九寨沟、黄龙、牟尼沟等多个自然保护区和水源保护地，对此项目部在制梁场配置了污水处理系统，确保施工废水零排放，同时对各铺架工点、桥机班生活垃圾采取随车携带、分类处理方式。“将每一辆运梁车变成移动“补给站”，为高原区段施工提供坚强保障。”中铁八局成兰铁路项目部经理张华称，全线T梁架设顺利完成，进一步加快了成兰铁路开通运营时间。
T型梁架设现场。 刘忠俊 摄据悉，成兰铁路建成后成都前往松潘仅需2小时左右，大大缩短了两地间的通行时间，对完善中国西部铁路网，让西南与西北两大区域联系更加紧密。(完)
| 玛雅彩票地图 |
